Het Phylogenetic Handbook is een brede hands-on gids voor theorie en praktijk van nucleotide en eiwit fylogenetische analyse. Deze tweede editie bevat zes nieuwe hoofdstukken over onderwerpen als Bayesiaanse inferentieboomtopologie, testen en de impact van recombinatie op fylogenieën, evenals een gedetailleerd gedeelte over moleculaire aanpassing. Het boek heeft een sterkere focus op het testen van hypothesen dan de vorige editie, met uitgebreidere discussies over recombinatieanalyse, het detecteren van moleculaire aanpassing en op genealogie gebaseerde populatiegenetica. Veel hoofdstukken bevatten uitgebreide praktische secties die zijn bijgewerkt om de lezer kennis te laten maken met de meest recente versies van sequentieanalyse en fylogeniesoftware, waaronder BLAST FastA Clustal T-coffee Muscle, DAMBE Tree-puzzle Phylip MEGA PAUP* IQPNNI CONSEL ModelTest Prottest PAML HYPHY, MrBayes BEAST, LAMARC SplitsTree en RDP. Veel analysetools worden beschreven door hun oorspronkelijke auteurs, wat resulteert in duidelijke uitleg die een ideale onderwijsgids vormt voor niet-gegradueerde en afgestudeerde studenten op gevorderd niveau. Taal: Engels